NDKmol - molecular viewer 0.97

Sobre NDKmol - molecular viewer

NDKmol - Espectador Molecular para Android == Sobre == NDKmol é um espectador molecular para Android. Pode-se ver estruturas tridimensionais de proteínas, ácidos nucleicos e pequenas moléculas. NDKmol suporta a maioria das representações comuns para moléculas, tais como fita, traço, vara, esfera e linha. A NDKmol também apoia operações de simetria; podem ser exibidos conjuntos biológicos e embalagem de cristais. Você pode pesquisar e baixar estruturas de RCSB PDB e NCBI Pubchem. NDKmol tem quase a mesma funcionalidade que GLmol, que está escrito em WebGL/Javascript e funciona em navegadores Web. Pode experimentar GLmol no http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html == Características == * Ler ficheiro PDB ou SDF/MOL * Rotação/Traduzir/Zoom modelo por dedo * Representações - Linha - Vara - Esfera (raio van der Waals) - Vestígios de carbono alfa - Fita (Fina ou Grossa) - Vertente - Tubo de fator B - Escada de ácido nucleico - Linha de ácido nucleico - "estrelas" solventes * Suavização das folhas beta * Coloração - Por cadeia - Por estrutura secundária (quando definido nos registos SHEET/HELIX) - Por Elementos - Gradação (também conhecida como chainbow) - Fator B - polar/não polar Cristalografia - Célula da unidade de exibição - Mostrar embalagem de cristais (quando definido na secção OBSERVA) - Apresentar montagem biológica (quando definido na secção OBSERVA) == Como Usar == Quando lançado, o NDKmol carrega automaticamente o Porin (PDBID: 2POR) como exemplo. Pode rodar a molécula pelo dedo. Para ampliar ou traduzir a molécula, prima o botão MENU no seu telemóvel/tablet e selecione o modo. Gestos de dois dedos também são apoiados. Tudo o resto pode ser feito a partir do MENU. Para carregar outros ficheiros PDB, por favor coloque o ficheiro no diretório "PDB" do cartão SD e selecione o comando "Open" no MENU. Também pode baixar estruturas diretamente do servidor web RCSB PDB e NCBI PubChem. Selecione "Pesquisar e Transferir" no menu. == Contacto == O site do projeto está localizado em http://webglmol.sourceforge.jp/. Pode obter códigos de origem para este programa a partir daqui. Os comentários e sugestões são bem-vindos em http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ ou [email protected] === Aviso de licença === A própria NDKmol é licenciada ao abrigo da GNU Lesser General Public License da seguinte forma. No entanto, os ficheiros PDB incluídos como exemplos estão em condições diferentes. Por favor, consulte http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html ------------- NDKmol - Espectador Molecular para Android (C) Copyright 2011, biochem_fan Este programa é software gratuito: pode redistribuí-lo e/ou modificar nos termos da Licença Pública Geral Menor GNU, publicada por a Free Software Foundation, quer a versão 3 da Licença, quer (a seu opção) qualquer versão posterior. Este programa é distribuído na esperança de que seja útil, mas SEM QUALQUER GARANTIA; sem mesmo a garantia implícita de MERCANTE OU APTIDÃO PARA UM PROPÓSITO ESPECÍFICO. Ver o GNU Licença Pública Geral Menor para mais detalhes. Devia ter recebido uma cópia da Licença Pública Geral Menor da GNU